我想商量一下月薪2500，年底他给我的是按一天的工资计算的

你提到老板年底按天计算工资给你，这种做法可能存在问题。根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。虽然法律未明确规定具体的计算方式，但通常工资是按照双方约定的月薪、年薪等标准支付。如果双方约定的是月薪，老板年底却按天计算，这可能构成对劳动合同的变更，需要双方协商一致。若未协商一致，老板单方面改变工资计算方式可能违反法律规定。因此，老板年底按天计算工资的做法，如未经你同意，可能不合法。具体法律依据可参考《中华人民共和国劳动法》第五十条关于工资支付的规定。
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从法律角度看，确保薪资权益不受侵害，你应：1.签订明确、详细的劳动合同，约定好薪资标准、支付方式等；2.保留好所有薪资支付证据，如工资条、银行流水等；3.了解并遵守劳动法律法规，如遇侵权，及时通过沟通、投诉、仲裁等方式维权；4.加入工会等组织，增强自身议价和维权能力。
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若认为老板年底按天计算工资不合理，你可先与老板沟通，明确合同约定的工资支付方式，要求按约定支付。沟通无果时，可向当地劳动监察部门投诉，提供劳动合同等证据。也可申请劳动仲裁，甚至提起诉讼。记得保留好所有与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录等。